Su experiencia como coordinadora de Atlas, donde lideró con éxito y con mínimas fricciones un colectivo de 3.000 de 38 países, ha tenido un papel decisivo en su elección como directora general del CERN.
Gianotti relevará en el puesto al alemán Rolf Dieter Heuer, que habrá estado en el cargo durante diez años, partir del 1 de enero de 2016. Ha sido elegida por el Consejo del CERN para un mandato de cinco años.En una visita al Institut de Fisica d’Altes Energies (IFAE) de Bellaterra en el 2009, explicó que coordinar un equipo de miles de personas de decenas de países, como deberá hacer ahora en el CERN a una escala mayor que la de Atlas, “es una experiencia humana maravillosa que requiere una gran capacidad de adaptación, de aprender a tratar con personas de culturas diferentes y a trabajar juntos”.
Su tema preferido para iniciar una conversación y romper el hielo con físicos de otas culturas, dijo, es la música “porque toco el piano, y la física tiene una belleza matemática que lo convierte en un buen tema de conversación entre físicos”.