Doscientos trabajos publicados por la Universidad de Standford centrados en la contraposición entre los alimentos ecológicos y los convencionales cuestionaba que las cualidades nutritivas de los productos ecológicos fueran superiores a las del resto. Las conclusiones del estudio de Standford del que se hacía eco El País, pese a reconocer la poca rigurosidad de los estudios realizados, eran contundentes: los alimentos ecológicos no eran más nutritivos.
Frente a estas afirmaciones, la SEAE ha elaborado una carta informe basada en varios estudios que prueban que los alimentos ecológicos sí son más nutritivos que los convencionales. Los estudios que se han tomado como base de la carta informe son, en su mayoría, de la doctora Raigón (universidad Politécnica de Valencia), quien forma parte de la SEAE y afirma que "las conclusiones del trabajo del Annals of Internal Medicine, hay que sesgarlas al ámbito de los trabajos analizados y de los tratamientos efectuados en el citado trabajo. Para sacar conclusiones del mismo -siempre de carácter parcial y dentro del ámbito del estudio- lo único válido son los trabajos realizados bajo la comparación en similitud de condiciones (tipo de suelo, condiciones climáticas, variedades, razas), y en este sentido son muchos, los estudios que afirman que existe mayor concentración de nutrientes en los obtenidos bajo técnicas de producción ecológica".
La polémica está servida ya que la SEAE no tiene intención de olvidar las conclusiones de sus estudios y menos todavía de continuar defendiendo un sistema agroalimentario basado en la agricultura ecológica, que consideran más sostenible y justa socialmente.
